בחירת חומר איטום מתחילה בזיהוי המשטח והחשיפה: לאיטום סביב כיור, אמבטיה וחלונות משתמשים בדרך כלל בסיליקון מתאים; לחיבורים, סדקים ומשטחים שדורשים גמישות ניתן לבחור חומר פוליאוריתני; ולגגות יש לבחור מערכת איטום לפי סוג הגג והוראות היצרן. חשוב לנקות ולייבש את המשטח לפני היישום ולבדוק התאמה לחומר הקיים.
אקדח סיליקון מתאים ליישום מדויק של חומרי איטום באריזת שפופרת. בוחרים אקדח שמתאים לגודל השפופרת ונוח לאחיזה, ומוודאים שמנגנון הדחיפה פועל בצורה חלקה. לפני העבודה חותכים את פיית השפופרת בזווית ובקוטר שמתאימים לרוחב החיבור, מנקים ומייבשים את המשטח, ומזרימים פס אחיד בתנועה רציפה. לאחר היישום מחליקים בעדינות לפי הוראות חומר האיטום ומנקים עודפים לפני שהם מתייבשים. חשוב להשתמש בחומר שמתאים למשטח ולחשיפה למים.